毛文龍被袁崇煥冤殺後，手下孔有德，耿仲明，尚可喜降清滅了明朝

毛文龍與後金書信圖

兵科給事中薛國觀的奏章裡面說：「毛文龍的職責是牽制後金不要來攻打寧遠，而不是殺多少後金兵。只要你能牽制好金兵，自然就是你的大功。如果金兵總是來犯寧遠、山海關，你毛文龍老是沒事運一些敵人的首級、俘虜過來報功，有什麼意義？」

這就是更錯誤的觀點了，後金就那麼點人口，殺傷有生力量肯定是解危的根本。躲在城後的文官們自身消極防禦，要讓毛文龍移到正面來給自己擋槍。當毛文龍不聽話還辯解時，那就只能弄死他，換一個聽話的人節制東江鎮了，這個人可以是袁崇煥。

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和袁崇煥的矛盾

袁崇煥被皇帝看得太重，他也意識到這點，借關寧軍自抬身價一路升官牟利。最後因為關寧防線和關寧軍離不開他，就等於明朝離不開他。袁崇煥也是被自己的自大信以為真，因此才敢矯詔殺毛文龍，替整個文官體系出頭，覺得皇帝不會動自己。

隨著毛文龍的官職越來越高，袁崇煥越發覺得自己受到威脅。沒有毛文龍的時候，關寧防線是明帝國的重點項目，自己是項目負責人，最受器重，整個國家勒緊褲腰帶把所有物資投給這個項目。而袁崇煥帶著東林黨一邊貪污一邊吹牛說「五年復遼」，皇帝信了，因此更加支持。